Сточные воды поступают в резервуар  грубой предварительной очистки, где оседает песок и на механических решётках удаляются остальные грубые нечистоты. Предварительно очищенная вода попадает в распределительный резервуар, где находится два электроклапана – по одному для каждого из реакторов SBR.
После наполнения реактора в нём начинается биологическая очистка – активация, которая обеспечит биологическое (частичное) удаление фосфора, азота и органического загрязнения. После активации в реакторе начинается осаждение ила, и после осаждения активированного ила начинается откачка чистой воды, откачка избыточного ила в илонакопитель. После этого цикла очистка заканчивается и реактор подготовлен к очередному циклу, оба реактора  работают по очереди.
В зависимости от количества поступающих вод компьютер автоматически оптимизирует работу системы в широком диапазоне от 5-200% проектной мощности. При малых притоках в системе остаётся такое количество очищенной воды, которое обязательно для обеспечения оптимальных условий биологических процессов. Одновременно автоматически понижается потребление электроэнергии в зависимости от снижения поступающих  стоков.
При увеличении объёма стоков  цикл очистки сокращается так, чтобы перед наполнением одного из двух реакторов другой был уже пуст. В интервале запрограммированных минимальных и максимальных величин отдельных параметров, станция реагирует немедленно на гидравлическую нагрузку.